Підготовка здобувачів вищої освіти ступеня доктора наук в БДМУ здійснюється на підставі Порядку підготовки здобувачів вищої освіти ступеня доктора філософії та доктора наук у вищих навчальних закладах (наукових установах), затвердженого постановою Кабінету Міністрів України від 23 березня 2016 року № 261 зі змінами, внесеними згідно з постановою Кабінету Міністрів України від 3 квітня 2019 року № 283 та Положення про підготовку здобувачів вищої освіти ступеня доктора філософії та доктора наук у Вищому державному навчальному закладі України «Буковинський державний медичний університет» за спеціальностями:
222 Медицина
- Акушерство та гінекологія
- Внутрішні хвороби
- Хірургія
- Дитяча хірургія
- Кардіологія
- Педіатрія
- Судова медицина
- Нормальна анатомія
- Патологічна фізіологія
228 Педіатрія